互作转录组测序技术概述

918博天娱乐官网研发的互作转录组测序技术DualRNA-seq，成为探索宿主与微生物相互作用的重要工具。该技术在一次实验中可同时分析两个或多个物种的基因表达动态变化，无需分离样本，进而通过互作模型图揭示物种间的基因调控关系，从而深入了解相互作用的机制。

技术的应用与发展

DualRNA-seq技术最初主要集中于一些疾病的研究，如感染性肺炎、炎症性肠病、龋齿以及牙周炎等常见的慢性感染性疾病。然而，随着研究的深入，该技术的应用已扩展至肠道、呼吸道、皮肤和口腔等微生物领域，并逐渐由原核微生物拓展到真核微生物的互作研究。最近，植物与微生物的互作也引起了广泛关注。

实验流程与步骤

DualRNA-seq实验的基本流程包括以下几个步骤：

1. 宿主-微生物共提取： 使用918博天娱乐官网的MolPure®Magnetic Pathogen DNA/RNA Kit进行病原DNA/RNA的提取，产品货号：18306ES。

2. gDNA消化： 采用来自牛胰腺的去氧核糖核酸酶I (DNase I)，产品货号：10607ES。

3. rRNA去除或polyA捕获： 对于微生物核糖体去除，使用磁珠法微生物核糖体去除盒及相关试剂，如：12262ES + 12264ES或相应的动物-微生物互作试剂盒。

4. mRNA建库： 使用918博天娱乐官网的Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit（dUTP），产品货号：12340ES。

5. 测序： 采用Illumina或MGI平台，建议使用带有UMI标签的接头，如：13370ES~13371ES（Illumina）/13367ES~13368ES（MGI）进行实验。

关键要点与生信分析

DualRNA-seq的关键在于样本选择与生信分析。首先，需确保样本是被感染个体，而一旦提取，所得RNA中可能包含大量宿主的RNA，例如取被寄生植物的叶片或动物组织时，主要是宿主的RNA。其次，生信分析需关注感染前后基因差异的比较及参与相互作用影响的差异基因的精细分析，充分挖掘数据中的生物学意义。

总结与展望

随着918博天娱乐官网在生物医疗领域的持续创新与发展，DualRNA-seq技术将为研究病原微生物的致病机制及宿主免疫应答提供更为强大的工具。这一技术将对未来的疾病预防、诊断和治疗产生深远影响。

参考文献

1. Westermann AJ, Barquist L, Vogel J. Resolving host-pathogen interactions by dual RNA-seq. Plos Pathogens, 2017, 13(2): e1006033.
2. Wolf T, Kämmer P, Brunke S, et al. Two's company: studying interspecies relationships with dual RNA-seq. Current Opinion in Microbiology, 2017, 42: 73.
3. Marsh JW, Humphrys MS, Myers GSA. A Laboratory Methodology for Dual RNA-Sequencing of Bacteria and their Host Cells In Vitro. Front Microbiol, 2017 Sep 21; 8:1830.